Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc12Q8K2L8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms