Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hacd3Q8K2C9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hacd3Q8K2C9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hacd3Q8K2C9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hacd3Q8K2C9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hacd3Q8K2C9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hacd3Q8K2C9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms