Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara5Q8K299 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms