Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gtf3c1Q8K284 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c1Q8K284 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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