Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pnpt1Q8K1R3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnpt1Q8K1R3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms