Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbc1d23Q8K0F1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbc1d23Q8K0F1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms