Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip10Q8CJ53 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms