Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LgsnQ8CIX8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms