Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwnkQ8CIW5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms