Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hpf1Q8CFE2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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