Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc17Q8CE13 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms