Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc178Q8CDV0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc178Q8CDV0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms