Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lrrc9Q8CDN9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc9Q8CDN9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms