Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CrebrfQ8CDG5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms