Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ephb1Q8CBF3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms