Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nrip1Q8CBD1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nrip1Q8CBD1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms