Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8C5C9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms