Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ska3Q8C263 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms