Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Usp38Q8BW70 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp38Q8BW70 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp38Q8BW70 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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