Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPK2

Zcchc3, Zinc finger, CCHC domain-containing 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc3Q8BPK2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc3Q8BPK2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc3Q8BPK2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms