Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms