Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms