Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4dQ8BGV9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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