Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc38a9Q8BGD6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a9Q8BGD6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms