Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp8Q80U87 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp8Q80U87 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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