Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clasp1Q80TV8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clasp1Q80TV8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms