Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
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