Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms