Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf516Q7TSH3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms