Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdp1Q7TSG2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms