Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EpopQ7TNS8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EpopQ7TNS8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EpopQ7TNS8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EpopQ7TNS8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EpopQ7TNS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms