Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HhipQ7TN16 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HhipQ7TN16 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms