Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim12Q78RX3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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