Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms