Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms