Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd3Q6ZQK0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms