Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Topbp1Q6ZQF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms