Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms