Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms