Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms