Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gapvd1Q6PAR5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms