Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms