Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Soga3Q6NZL0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Soga3Q6NZL0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms