Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HelbQ6NVF4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms