Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms