Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep78Q6IRU7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms