Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms