Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KdsrQ6GV12 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KdsrQ6GV12 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms