Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp7Q6A4J8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms