Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms